Curso

INTRODUCCIÓN A LA CIENCIA DE DATOS GENÓMICOS

Datos básicos

Fechas de inicio y fin

Del 8/07/19 al 12/07/19

Fecha de matrícula

Actividad no disponible desde el 1/07/19


Duración

15 horas presenciales,
1,5 Créditos ECTS

Lugar de Impartición

Laboratorio 1G-1.1 Torres Quevedo
VALÈNCIA

Horario

TARDE

De lunes a viernes de 16h a 19h.

Precio

150 €
150,00 € - Público en general
115,00 € - Personal UPV
115,00 € - Alumno UPV
115,00 € - Alumni UPV PLUS o AAA UPV



Temas a desarrollar

Sesión 1: Aproximación a la Gestión de Datos Genómicos... Orientación hacia una Medicina de Precisión (MP) - 3hrs.
● Definición de Ciencia de Datos Genómicos.
● Definición de Medicina de Precisión.
● Introducción a la identificación de variaciones genómicas a partir de la muestra de un paciente.

Sesión 2: Tecnologías de manipulación de ficheros VCF - 3hrs.
● Introducción a los ficheros de variaciones genómicas (VCF).
● Introducción a la creación de scripts de shell en Unix.
● Introducción a las bases de datos relacionales (MySQL).
● Introducción a las bases de datos no relacionales (Neo4J).

Sesión 3: Práctica 001 -> Manipulación de ficheros VCF mediante comandos de shell - 3hrs.

Sesión 4: Práctica 002 -> Manipulación de ficheros VCF mediante consultas SQL - 3hrs.

Sesión 5: Práctica 003 -> Manipulación de ficheros VCF mediante consultas con Cypher - 3hrs.

Más información

Acción formativa dirigida a:

Este curso está dirigido a profesionales y alumnos con conocimientos generales de informática que deseen ampliar su formación sobre el manejo de datos genómicos.

Se recomienda cierta familiaridad con la definición de los elementos básicos que componen el ADN (genes, cromosomas, nucleótidos, etc.) así como nociones sobre bases de datos.

Aunque estos conocimientos no son absolutamente imprescindibles permitirán una mejor comprensión del material a tratar durante el curso.

Metodología didáctica:

Este curso presencial está estructurado en 5 sesiones: 2 sesiones de teoría y 3 sesiones prácticas. Cada unidad lleva asociado un documento o guía que ayudará al alumno a conseguir los objetivos propuestos para cada sesión.

Estos son los principales recursos didácticos utilizados en el curso:
● Documentos de texto, donde se explican las ideas tratadas en las sesiones.
● Boletines de prácticas, donde se propone al alumno la realización de una serie de consultas sobre ficheros VCF de acuerdo a las tres tecnologías explicadas en las sesiones de teoría.
● Entorno pre-configurado de realización de prácticas, al cual los alumnos se conectan para poder realizar las prácticas: entorno de consultas SQL y Neo4J.
● Tutorías presenciales.

Las prácticas se desarrollarán en las últimas tres sesiones del curso, permitiendo al alumno evaluar su proceso de aprendizaje.

Conocimientos previos necesarios:

Graduados o estudiantes de grado de las siguientes titulaciones: Ingeniería Informática, Ingeniería de Telecomunicaciones, Ingeniería Biomédica, Bioinformática y Biotecnología.

Responsable de actividad

Silvia mª Terrasa Barrena

Profesorado

espacioOscar Pastor Lopez
espacioJosé Fabián Reyes Román

Contacto

Correo electrónico

Amparo Cuesta Falomir

Promovido por

ESCUELA TÉCNICA SUPERIOR DE INGENIERÍA INFORMÁTICA


Condiciones

Condiciones generales

Consulte las Condiciones generales de la actividad.

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